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최근 수정 시각 : 2024-08-14 14:46:17

게놈 브라우저



1. 개요2. 소개

1. 개요

게놈 브라우저(Genom Browser)는 게놈 데이터를 시각적으로 탐색하고 분석할 수 있는 웹이다.

2. 소개

인터넷도 구글, 네이버 등 다양한 사이트들이 존재하듯, 게놈 브라우저도 다양한 사이트들이 존재한다.

이들의 주요 기능은 유전자 위치 탐색, 유전자 구조 및 주석, 데이터 트랙, 변이 분석, 종 간 유연관계 분석 등을 쉽게 이해하고 연구할 수 있게 도와주는 브라우저다.

좀 더 구체적으로 특정 유전자의 위치를 쉽게 찾을 수 있게 함으로써 관심 있는 유전자나 염색체의 특정 위치를 입력하면, 그에 해당하는 유전체 영역이 화면에 표시되면서, 유전자가 어디에 위치해 있는지, 어떤 구조를 가지고 있는지, 그리고 그 유전자에 대한 주석 정보를 시각적으로 확인할 수 있다.

또 게놈 브라우저는 여러 데이터를 트랙(track)으로 추가할 수 있는 기능을 제공한다. 예를 들어, 유전자 위치, 단백질 결합 부위, 변이(SNPs), 진화적 보존 영역 등을 각각의 트랙으로 추가하여 한 화면에서 비교 분석할 수 있다.

UCSC, Ensemble, DECIPHER, UniPro 등이 있으며, 오늘 날 현대 생물학자들은 Ensemble Genom Browser를 가장 많이 사용한다.[1]
[1] 그 이유는 앙상블은 SNP 변이에 특화된 데이터베이스이기 때문이다. 오늘날 대다수 유전적 변이는 SNP를 기반으로 연구를 하고 변이를 설명한다. 물론 경우에 따라 STR을 사용하는 경우가 있다.